Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC4Q8N9L1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC4Q8N9L1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.8 ms