Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPICE1Q8N0Z3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms