Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KSR1Q8IVT5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms