Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLD3Q8IV08 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLD3Q8IV08 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms