Protein–RNA interactions for Protein: Q86X52

CHSY1, Chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1Q86X52 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHSY1Q86X52 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY1Q86X52 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms