Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALYREFQ86V81 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms