Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP3Q7RTS5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP3Q7RTS5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP3Q7RTS5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms