Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
H2AFVQ71UI9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2AFVQ71UI9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms