Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNG9

KRBA2, KRAB-A domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA2Q6ZNG9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRBA2Q6ZNG9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRBA2Q6ZNG9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KRBA2Q6ZNG9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms