Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms