Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM220Q6QAJ8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms