Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMF1Q6P1K2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMF1Q6P1K2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms