Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUQ1

RINT1, RAD50-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RINT1Q6NUQ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RINT1Q6NUQ1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RINT1Q6NUQ1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RINT1Q6NUQ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RINT1Q6NUQ1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RINT1Q6NUQ1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RINT1Q6NUQ1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RINT1Q6NUQ1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RINT1Q6NUQ1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RINT1Q6NUQ1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RINT1Q6NUQ1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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