Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMBRD2Q68DH5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMBRD2Q68DH5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMBRD2Q68DH5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms