Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RPRD2Q5VT52 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RPRD2Q5VT52 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RPRD2Q5VT52 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms