Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGSNQ5TDP6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGSNQ5TDP6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms