Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1LQ5PSV4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1LQ5PSV4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms