Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ANKRD39Q53RE8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39Q53RE8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms