Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF1Q17RB8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF1Q17RB8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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