Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPROQ16827 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPROQ16827 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPROQ16827 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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