Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 NOP56-219ENST00000612233 2980 nt12.06□□□□□ -0.484e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SFI1-212ENST00000452250 2625 ntTSL 212.01□□□□□ -0.494e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SFI1-226ENST00000491973 580 ntTSL 411.81□□□□□ -0.524e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.594e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.594e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 NOP56-216ENST00000492135 1143 ntTSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.64e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SRSF7-203ENST00000415527 1135 ntTSL 511.3□□□□□ -0.64e-9■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SFI1-202ENST00000382162 5250 ntTSL 211.01□□□□□ -0.654e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.684e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.764e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 ACIN1-217ENST00000555566 734 ntTSL 39.81□□□□□ -0.844e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 ACIN1-221ENST00000557432 642 ntTSL 39.78□□□□□ -0.844e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SFI1-203ENST00000400288 4002 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.854e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SRSF7-201ENST00000313117 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.934e-9■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 NOP56-206ENST00000466447 1094 ntTSL 29.15□□□□□ -0.944e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SRSF7-206ENST00000431066 1847 ntTSL 59.15□□□□□ -0.954e-9■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SRSF7-209ENST00000446327 2453 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.974e-9■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SFI1-204ENST00000400289 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.974e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SRSF7-208ENST00000443213 1903 ntTSL 58.72□□□□□ -1.014e-9■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SRSF7-205ENST00000425941 1944 ntTSL 58.43□□□□□ -1.064e-9■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 NOP56-202ENST00000415272 1628 ntTSL 58.18□□□□□ -1.14e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 ACIN1-208ENST00000553721 610 ntTSL 37.94□□□□□ -1.144e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 ACIN1-212ENST00000554979 366 ntTSL 27.68□□□□□ -1.184e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 ACIN1-214ENST00000555352 579 ntTSL 47.6□□□□□ -1.194e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 NOP56-215ENST00000490753 640 ntTSL 27.55□□□□□ -1.24e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SRSF7-204ENST00000425778 2857 ntTSL 27.54□□□□□ -1.24e-9■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 ACIN1-207ENST00000553501 716 ntTSL 27.53□□□□□ -1.24e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 NOP56-207ENST00000467196 1320 ntTSL 56.58□□□□□ -1.364e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 CFI-207ENST00000618244 1345 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.374e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.424e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 NOP56-211ENST00000471023 592 ntTSL 25.99□□□□□ -1.454e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.464e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.474e-9■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.534e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 NOP56-212ENST00000480447 651 ntTSL 24.78□□□□□ -1.644e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.734e-6■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SRSF7-210ENST00000452806 747 ntTSL 23.72□□□□□ -1.814e-9■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 SRSF7-212ENST00000487773 637 ntTSL 53.69□□□□□ -1.824e-11■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 NAP1L1-208ENST00000547529 892 ntTSL 54.76□□□□□ -1.651e-8■■□□□ 13.4
SRSF7Q16629 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.091e-10■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 CTSL-206ENST00000495822 988 ntTSL 1 (best)11.49□□□□□ -0.571e-10■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.581e-10■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 CTSL-204ENST00000375894 975 ntTSL 310.58□□□□□ -0.721e-10■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 CTSL-205ENST00000482054 908 ntTSL 29.95□□□□□ -0.821e-10■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.851e-10■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.322e-6■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.132e-6■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.223e-25■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.033e-25■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.033e-25■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.223e-25■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.253e-25■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.373e-25■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.513e-25■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 TNS3-204ENST00000428457 5070 ntTSL 1 (best)8.17□□□□□ -1.13e-10■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.054e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 MDM4-211ENST00000470908 884 ntTSL 510.17□□□□□ -0.784e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 MDM4-210ENST00000470797 909 ntTSL 210.05□□□□□ -0.84e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 NUP214-209ENST00000489260 649 ntTSL 38.84□□□□□ -0.994e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 MDM4-209ENST00000463049 6102 ntTSL 58.35□□□□□ -1.074e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 NUP214-215ENST00000525980 2274 ntTSL 27.63□□□□□ -1.194e-7■■□□□ 13.3
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SRSF7Q16629 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.34e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 NASP-218ENST00000530073 2740 ntTSL 26.71□□□□□ -1.334e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 MDM4-212ENST00000471783 552 ntTSL 36.71□□□□□ -1.344e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.374e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 NASP-210ENST00000481782 3659 ntTSL 26.27□□□□□ -1.414e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.414e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.424e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.424e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.484e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.484e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.514e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.824e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.864e-7■■□□□ 13.3
SRSF7Q16629 EIF4A2-225ENST00000496382 460 ntTSL 1 (best)5.13□□□□□ -1.594e-13■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 NPM1-208ENST00000521672 597 ntTSL 56.75□□□□□ -1.332e-17■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 RN7SKP176-201ENST00000363673 318 ntBASIC9.51□□□□□ -0.891e-7■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.911e-7■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 MORF4L2-204ENST00000422355 562 ntTSL 27.86□□□□□ -1.153e-6■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 MORF4L2-201ENST00000360458 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.213e-6■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 MORF4L2-203ENST00000422154 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.283e-6■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.343e-6■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.353e-6■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 MORF4L2-210ENST00000451301 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.353e-6■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 MORF4L2-209ENST00000442614 869 ntTSL 26.11□□□□□ -1.433e-6■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 MORF4L2-207ENST00000434230 899 ntTSL 26.02□□□□□ -1.453e-6■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 MORF4L2-202ENST00000418819 849 ntTSL 35.9□□□□□ -1.463e-6■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 MORF4L2-215ENST00000498064 451 ntTSL 25.76□□□□□ -1.493e-6■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 MORF4L2-214ENST00000492116 582 ntTSL 25.72□□□□□ -1.493e-6■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 MORF4L2-211ENST00000467755 370 ntTSL 1 (best)4.01□□□□□ -1.773e-6■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.374e-7■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.484e-7■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 ITIH3-201ENST00000416872 2220 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.864e-7■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.994e-7■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 SETD5-201ENST00000302463 4786 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.134e-7■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.184e-7■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 SETD5-208ENST00000421188 1323 ntTSL 57.32□□□□□ -1.244e-7■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.254e-7■■□□□ 13.2
SRSF7Q16629 ITIH3-211ENST00000621946 3038 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.274e-7■■□□□ 13.2
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