Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA4Q16363 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAMA4Q16363 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA4Q16363 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
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