Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USF2Q15853 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USF2Q15853 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USF2Q15853 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USF2Q15853 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USF2Q15853 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USF2Q15853 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USF2Q15853 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USF2Q15853 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USF2Q15853 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USF2Q15853 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USF2Q15853 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USF2Q15853 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USF2Q15853 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USF2Q15853 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USF2Q15853 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USF2Q15853 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USF2Q15853 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USF2Q15853 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USF2Q15853 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USF2Q15853 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USF2Q15853 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USF2Q15853 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
USF2Q15853 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USF2Q15853 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USF2Q15853 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USF2Q15853 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USF2Q15853 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USF2Q15853 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USF2Q15853 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USF2Q15853 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USF2Q15853 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USF2Q15853 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USF2Q15853 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USF2Q15853 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USF2Q15853 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USF2Q15853 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USF2Q15853 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USF2Q15853 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USF2Q15853 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USF2Q15853 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USF2Q15853 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USF2Q15853 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USF2Q15853 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USF2Q15853 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USF2Q15853 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USF2Q15853 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USF2Q15853 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USF2Q15853 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USF2Q15853 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USF2Q15853 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USF2Q15853 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USF2Q15853 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USF2Q15853 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USF2Q15853 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USF2Q15853 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USF2Q15853 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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