Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB39AQ14964 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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RAB39AQ14964 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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RAB39AQ14964 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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RAB39AQ14964 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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RAB39AQ14964 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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RAB39AQ14964 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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RAB39AQ14964 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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RAB39AQ14964 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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RAB39AQ14964 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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RAB39AQ14964 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB39AQ14964 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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RAB39AQ14964 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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RAB39AQ14964 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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RAB39AQ14964 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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RAB39AQ14964 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB39AQ14964 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
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