Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 MRPS6-202ENST00000477091 1061 ntTSL 517.94■□□□□ 0.463e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.341e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 GRAMD1A-213ENST00000603669 552 ntTSL 516.95■□□□□ 0.31e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.273e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.213e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 POR-203ENST00000412521 586 ntTSL 416.08■□□□□ 0.161e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 MAD1L1-215ENST00000464742 449 ntTSL 516.04■□□□□ 0.161e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.151e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.151e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 POR-212ENST00000447222 2332 ntTSL 515.73■□□□□ 0.111e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 MAD1L1-210ENST00000444373 535 ntTSL 415.69■□□□□ 0.11e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 POR-216ENST00000454934 2295 ntTSL 315.63■□□□□ 0.091e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.051e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 POR-210ENST00000439297 569 ntTSL 415.12■□□□□ 0.011e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 POR-213ENST00000448410 1104 ntTSL 314.98□□□□□ -0.011e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.051e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 PANK4-209ENST00000502770 1041 ntTSL 1 (best)14.75□□□□□ -0.051e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.061e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 MAD1L1-209ENST00000438959 839 ntTSL 314.29□□□□□ -0.121e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.131e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.161e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 MAD1L1-222ENST00000491858 494 ntTSL 414□□□□□ -0.171e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 POR-202ENST00000412064 1044 ntTSL 513.92□□□□□ -0.181e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 POR-211ENST00000439963 625 ntTSL 413.92□□□□□ -0.181e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.211e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.231e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 POR-215ENST00000453773 498 ntTSL 413.57□□□□□ -0.241e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.241e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.241e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.251e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TTLL12-202ENST00000484118 636 ntTSL 313.27□□□□□ -0.291e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 POR-208ENST00000432753 561 ntTSL 413.12□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 ARHGAP45-209ENST00000587602 3875 ntTSL 212.93□□□□□ -0.341e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 BCOR-207ENST00000412952 288 ntTSL 512.84□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.391e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.391e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 HNRNPL-203ENST00000595164 2404 ntTSL 212.56□□□□□ -0.41e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.441e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.444e-7■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 POR-207ENST00000426184 565 ntTSL 411.46□□□□□ -0.571e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 GRAMD1A-206ENST00000598073 582 ntTSL 311.45□□□□□ -0.581e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 GRAMD1A-204ENST00000594597 567 ntTSL 411.24□□□□□ -0.611e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 POR-220ENST00000475509 590 ntTSL 510.9□□□□□ -0.661e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 POR-204ENST00000414186 548 ntTSL 410.51□□□□□ -0.731e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 HNRNPL-206ENST00000597731 3094 ntTSL 29.88□□□□□ -0.831e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 UQCR10-202ENST00000401406 584 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.841e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 ATXN2-209ENST00000482777 4369 ntTSL 29.75□□□□□ -0.851e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 AC078814.1-201ENST00000484568 645 ntBASIC9.39□□□□□ -0.917e-9■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.231e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.231e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.271e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 SLIRP-203ENST00000554074 445 ntTSL 37.07□□□□□ -1.281e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 57□□□□□ -1.293e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.381e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 ATXN2-213ENST00000495342 813 ntTSL 36.1□□□□□ -1.431e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.441e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 ATXN2-203ENST00000389154 1794 ntTSL 55.56□□□□□ -1.521e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 ATXN2-222ENST00000550889 1703 ntTSL 24.63□□□□□ -1.671e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 ATXN2-224ENST00000551755 695 ntTSL 54.47□□□□□ -1.691e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 KIF20A-202ENST00000502338 600 ntTSL 34.4□□□□□ -1.711e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.761e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 RELA-207ENST00000526257 215 ntTSL 1 (best)3.81□□□□□ -1.81e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.883e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 ATG3-208ENST00000495756 1455 ntTSL 1 (best)18.56■□□□□ 0.561e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.361e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.281e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 MARCH6-210ENST00000511802 4734 ntTSL 27.47□□□□□ -1.216e-9■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.356e-9■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 POLR2A-209ENST00000617998 6751 ntTSL 1 (best)10.73□□□□□ -0.697e-7■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TPGS2-203ENST00000585635 1070 ntTSL 326.99■■□□□ 1.913e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TPGS2-205ENST00000587207 687 ntTSL 324.3■■□□□ 1.483e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TPGS2-211ENST00000590337 579 ntTSL 424.3■■□□□ 1.483e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.633e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.323e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.323e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TPGS2-207ENST00000587511 582 ntTSL 216.92■□□□□ 0.33e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.283e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TPGS2-217ENST00000591823 803 ntTSL 215.9■□□□□ 0.143e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.093e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TPGS2-214ENST00000590692 572 ntTSL 414.6□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.13e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.113e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC8.67□□□□□ -1.023e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TPGS2-206ENST00000587382 2079 ntTSL 37.78□□□□□ -1.163e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TPGS2-218ENST00000591906 936 ntTSL 37.5□□□□□ -1.213e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TPGS2-212ENST00000590500 488 ntTSL 34.2□□□□□ -1.743e-6■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.261e-23■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.471e-23■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 GTF3A-202ENST00000419181 1191 ntTSL 1 (best)20.95■□□□□ 0.947e-7■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.697e-7■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.347e-7■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 GTF3A-206ENST00000470606 1919 ntTSL 27.78□□□□□ -1.167e-7■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TCOF1-214ENST00000515035 5240 ntTSL 212.96□□□□□ -0.349e-7■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 TCOF1-203ENST00000394269 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.729e-7■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 RNF220-209ENST00000474064 2734 ntTSL 219.82■□□□□ 0.763e-7■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 RNF220-214ENST00000484745 1951 ntTSL 516.53■□□□□ 0.243e-7■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.33e-7■■■□□ 15.3
PUM1Q14671 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.33e-7■■■□□ 15.3
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