Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA3FQ13275 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA3FQ13275 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms