Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA4Q13156 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPA4Q13156 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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