Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TWF1Q12792 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TWF1Q12792 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
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