Protein–RNA interactions for Protein: Q02221

COX6A2, Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A2Q02221 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A2Q02221 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6A2Q02221 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms