Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX1P83916 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX1P83916 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX1P83916 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX1P83916 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX1P83916 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX1P83916 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX1P83916 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX1P83916 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX1P83916 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX1P83916 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX1P83916 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX1P83916 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX1P83916 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX1P83916 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX1P83916 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX1P83916 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX1P83916 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX1P83916 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX1P83916 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX1P83916 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX1P83916 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX1P83916 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX1P83916 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX1P83916 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX1P83916 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX1P83916 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX1P83916 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBX1P83916 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBX1P83916 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBX1P83916 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBX1P83916 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBX1P83916 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX1P83916 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX1P83916 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX1P83916 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX1P83916 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX1P83916 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX1P83916 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX1P83916 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX1P83916 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX1P83916 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX1P83916 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX1P83916 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX1P83916 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX1P83916 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX1P83916 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX1P83916 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX1P83916 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX1P83916 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX1P83916 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX1P83916 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX1P83916 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX1P83916 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX1P83916 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX1P83916 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX1P83916 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX1P83916 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX1P83916 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX1P83916 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX1P83916 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX1P83916 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX1P83916 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX1P83916 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX1P83916 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX1P83916 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX1P83916 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX1P83916 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX1P83916 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX1P83916 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX1P83916 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX1P83916 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX1P83916 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX1P83916 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX1P83916 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX1P83916 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX1P83916 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX1P83916 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX1P83916 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX1P83916 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX1P83916 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX1P83916 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms