Protein–RNA interactions for Protein: P78344

EIF4G2, Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4G2P78344 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.511e-6■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 GRAMD1A-212ENST00000600231 2534 ntTSL 230.48■■■□□ 2.471e-6■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.351e-6■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 GRAMD1A-213ENST00000603669 552 ntTSL 520.76■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 GRAMD1A-204ENST00000594597 567 ntTSL 414.26□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.72e-8■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.242e-8■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.112e-8■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 VPS53-215ENST00000573028 3204 ntTSL 223.74■■□□□ 1.392e-8■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 VPS53-218ENST00000575207 575 ntTSL 421.27■■□□□ 12e-8■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 VPS53-202ENST00000389040 1903 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 VPS53-220ENST00000576149 2444 ntTSL 514.17□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 VPS53-203ENST00000401468 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 VPS53-213ENST00000572334 561 ntTSL 59.28□□□□□ -0.922e-8■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.932e-8■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 VPS53-219ENST00000576019 613 ntTSL 38.63□□□□□ -1.032e-8■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.896e-9■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.846e-9■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 TEPSIN-207ENST00000573295 2552 ntTSL 223.18■■□□□ 1.36e-9■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 TEPSIN-204ENST00000571115 551 ntTSL 320.27■□□□□ 0.846e-9■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 TEPSIN-212ENST00000576090 3642 ntTSL 216.6■□□□□ 0.256e-9■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.723e-7■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.23e-7■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.723e-8■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.33e-8■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 MPP1-206ENST00000417435 970 ntTSL 524.7■■□□□ 1.541e-7■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.431e-7■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.311e-7■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.981e-7■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 MPP1-218ENST00000494170 969 ntTSL 320.65■□□□□ 0.91e-7■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 MPP1-212ENST00000475943 860 ntTSL 1 (best)19.56■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 MPP1-210ENST00000462825 587 ntTSL 418.84■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 MPP1-207ENST00000428488 581 ntTSL 317.76■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 MPP1-208ENST00000439370 2066 ntTSL 517.57■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 MPP1-209ENST00000453245 729 ntTSL 517.54■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 MPP1-203ENST00000393529 794 ntTSL 511.93□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 MPP1-215ENST00000488754 553 ntTSL 310.73□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 MPP1-214ENST00000488694 550 ntTSL 28.68□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 33.8
EIF4G2P78344 PLPPR2-203ENST00000586431 635 ntTSL 432.57■■■□□ 2.82e-6■■■■■ 33.7
EIF4G2P78344 PLPPR2-202ENST00000586380 535 ntTSL 431.61■■■□□ 2.652e-6■■■■■ 33.7
EIF4G2P78344 PLPPR2-207ENST00000591329 633 ntTSL 227.6■■■□□ 2.012e-6■■■■■ 33.7
EIF4G2P78344 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.72e-6■■■■■ 33.7
EIF4G2P78344 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 33.7
EIF4G2P78344 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.195e-7■■■■■ 33.6
EIF4G2P78344 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 33.6
EIF4G2P78344 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 33.6
EIF4G2P78344 MICAL1-204ENST00000433205 754 ntTSL 518.82■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 33.6
EIF4G2P78344 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 33.6
EIF4G2P78344 MICAL1-206ENST00000465904 4381 ntTSL 217.35■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 33.6
EIF4G2P78344 MICAL1-205ENST00000456101 4112 ntTSL 216.42■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 33.6
EIF4G2P78344 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.954e-12■■■■■ 33.6
EIF4G2P78344 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.198e-7■■■■■ 33.6
EIF4G2P78344 NOL4L-201ENST00000201961 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 332.98■■■□□ 2.875e-7■■■■■ 33.5
EIF4G2P78344 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.272e-8■■■■■ 33.5
EIF4G2P78344 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 33.5
EIF4G2P78344 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 33.5
EIF4G2P78344 SPTB-208ENST00000556626 10153 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 33.5
EIF4G2P78344 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.061e-6■■■■■ 33.5
EIF4G2P78344 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.751e-6■■■■■ 33.5
EIF4G2P78344 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.481e-6■■■■■ 33.5
EIF4G2P78344 FAM53A-206ENST00000489029 628 ntTSL 324.03■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 33.5
EIF4G2P78344 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.311e-6■■■■■ 33.5
EIF4G2P78344 RPTOR-208ENST00000574767 2461 ntTSL 222.31■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 33.5
EIF4G2P78344 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 33.5
EIF4G2P78344 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.763e-7■■■■■ 33.5
EIF4G2P78344 RUNX1-208ENST00000455571 610 ntTSL 325.55■■□□□ 1.683e-7■■■■■ 33.4
EIF4G2P78344 RUNX1-214ENST00000475045 1582 ntTSL 515.6■□□□□ 0.093e-7■■■■■ 33.4
EIF4G2P78344 F11-AS1-202ENST00000508110 1512 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.58e-7■■■■■ 33.4
EIF4G2P78344 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.118e-7■■■■■ 33.4
EIF4G2P78344 F11-AS1-203ENST00000508287 669 ntTSL 35.61□□□□□ -1.518e-7■■■■■ 33.4
EIF4G2P78344 USP15-206ENST00000546718 559 ntTSL 219.82■□□□□ 0.763e-6■■■■■ 33.4
EIF4G2P78344 USP15-216ENST00000550632 728 ntTSL 319.82■□□□□ 0.763e-6■■■■■ 33.4
EIF4G2P78344 USP15-217ENST00000551206 1022 ntTSL 218.2■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 33.4
EIF4G2P78344 USP15-215ENST00000549523 584 ntTSL 515.7■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 33.4
EIF4G2P78344 USP15-204ENST00000537297 579 ntTSL 214.61□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 33.4
EIF4G2P78344 USP15-208ENST00000548524 648 ntTSL 213.23□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 33.4
EIF4G2P78344 USP15-202ENST00000312635 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 33.4
EIF4G2P78344 USP15-210ENST00000548836 579 ntTSL 310.63□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 33.4
EIF4G2P78344 USP15-212ENST00000549237 791 ntTSL 38.85□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 33.4
EIF4G2P78344 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 33.4
EIF4G2P78344 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.713e-6■■■■■ 33.4
EIF4G2P78344 AC008667.1-201ENST00000515296 568 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 33.3
EIF4G2P78344 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.057e-7■■■■■ 33.3
EIF4G2P78344 B4GALT2-206ENST00000485678 943 ntTSL 326.43■■□□□ 1.827e-7■■■■■ 33.3
EIF4G2P78344 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.547e-7■■■■■ 33.3
EIF4G2P78344 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.751e-7■■■■■ 33.3
EIF4G2P78344 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.741e-7■■■■■ 33.3
EIF4G2P78344 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.511e-7■■■■■ 33.3
EIF4G2P78344 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.481e-7■■■■■ 33.3
EIF4G2P78344 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.171e-7■■■■■ 33.3
EIF4G2P78344 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 33.3
EIF4G2P78344 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 33.3
EIF4G2P78344 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 33.3
EIF4G2P78344 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 33.3
EIF4G2P78344 ARID3A-205ENST00000587532 1016 ntTSL 525.21■■□□□ 1.635e-7■■■■■ 33.2
EIF4G2P78344 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.375e-7■■■■■ 33.2
EIF4G2P78344 ARID3A-202ENST00000457152 549 ntTSL 518.15■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 33.2
EIF4G2P78344 LPCAT1-206ENST00000514484 756 ntTSL 326.36■■□□□ 1.813e-6■■■■■ 33.2
Retrieved 100 of 8,962 protein–RNA pairs in 172.1 ms