Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNRPNP63162 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNRPNP63162 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNRPNP63162 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNRPNP63162 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNRPNP63162 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPNP63162 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPNP63162 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPNP63162 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPNP63162 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms