Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23BP54727 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD23BP54727 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD23BP54727 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms