Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB28P51157 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB28P51157 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB28P51157 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB28P51157 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB28P51157 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB28P51157 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB28P51157 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB28P51157 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB28P51157 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB28P51157 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB28P51157 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB28P51157 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB28P51157 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB28P51157 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB28P51157 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB28P51157 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB28P51157 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB28P51157 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB28P51157 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB28P51157 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB28P51157 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB28P51157 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB28P51157 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB28P51157 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB28P51157 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB28P51157 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB28P51157 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB28P51157 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB28P51157 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB28P51157 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB28P51157 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB28P51157 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB28P51157 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB28P51157 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB28P51157 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB28P51157 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB28P51157 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB28P51157 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB28P51157 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB28P51157 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB28P51157 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB28P51157 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB28P51157 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB28P51157 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB28P51157 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB28P51157 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB28P51157 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB28P51157 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB28P51157 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB28P51157 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB28P51157 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB28P51157 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB28P51157 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB28P51157 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB28P51157 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB28P51157 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB28P51157 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB28P51157 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB28P51157 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB28P51157 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB28P51157 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB28P51157 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB28P51157 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB28P51157 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB28P51157 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB28P51157 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB28P51157 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB28P51157 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB28P51157 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB28P51157 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB28P51157 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB28P51157 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB28P51157 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB28P51157 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB28P51157 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB28P51157 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB28P51157 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB28P51157 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB28P51157 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB28P51157 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB28P51157 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB28P51157 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB28P51157 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB28P51157 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB28P51157 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB28P51157 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB28P51157 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB28P51157 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB28P51157 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB28P51157 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB28P51157 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB28P51157 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB28P51157 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB28P51157 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB28P51157 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB28P51157 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB28P51157 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB28P51157 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB28P51157 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms