Protein–RNA interactions for Protein: P50552

VASP, Vasodilator-stimulated phosphoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASPP50552 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VASPP50552 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VASPP50552 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VASPP50552 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VASPP50552 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VASPP50552 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VASPP50552 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VASPP50552 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VASPP50552 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VASPP50552 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VASPP50552 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VASPP50552 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VASPP50552 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VASPP50552 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VASPP50552 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VASPP50552 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VASPP50552 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VASPP50552 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VASPP50552 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VASPP50552 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VASPP50552 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VASPP50552 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VASPP50552 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VASPP50552 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VASPP50552 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VASPP50552 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VASPP50552 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VASPP50552 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VASPP50552 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VASPP50552 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VASPP50552 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VASPP50552 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VASPP50552 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VASPP50552 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VASPP50552 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VASPP50552 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VASPP50552 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VASPP50552 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VASPP50552 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VASPP50552 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VASPP50552 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VASPP50552 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VASPP50552 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VASPP50552 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VASPP50552 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VASPP50552 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VASPP50552 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VASPP50552 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VASPP50552 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VASPP50552 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VASPP50552 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VASPP50552 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VASPP50552 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VASPP50552 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VASPP50552 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VASPP50552 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VASPP50552 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VASPP50552 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VASPP50552 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VASPP50552 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VASPP50552 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VASPP50552 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VASPP50552 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VASPP50552 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VASPP50552 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VASPP50552 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VASPP50552 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VASPP50552 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VASPP50552 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VASPP50552 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VASPP50552 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VASPP50552 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VASPP50552 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VASPP50552 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VASPP50552 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VASPP50552 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VASPP50552 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VASPP50552 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VASPP50552 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VASPP50552 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VASPP50552 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VASPP50552 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VASPP50552 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VASPP50552 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VASPP50552 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VASPP50552 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VASPP50552 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VASPP50552 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VASPP50552 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VASPP50552 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VASPP50552 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VASPP50552 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VASPP50552 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VASPP50552 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VASPP50552 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VASPP50552 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VASPP50552 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VASPP50552 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VASPP50552 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VASPP50552 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms