Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR4A2P43354 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR4A2P43354 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms