Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC1A4P43007 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms