Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMPOP42166 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMPOP42166 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMPOP42166 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMPOP42166 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMPOP42166 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMPOP42166 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMPOP42166 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMPOP42166 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMPOP42166 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMPOP42166 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMPOP42166 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMPOP42166 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMPOP42166 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMPOP42166 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMPOP42166 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TMPOP42166 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMPOP42166 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMPOP42166 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMPOP42166 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMPOP42166 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TMPOP42166 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TMPOP42166 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMPOP42166 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMPOP42166 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMPOP42166 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMPOP42166 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMPOP42166 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TMPOP42166 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMPOP42166 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMPOP42166 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMPOP42166 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMPOP42166 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMPOP42166 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMPOP42166 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMPOP42166 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMPOP42166 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TMPOP42166 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMPOP42166 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMPOP42166 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMPOP42166 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMPOP42166 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMPOP42166 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMPOP42166 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMPOP42166 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMPOP42166 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMPOP42166 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TMPOP42166 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TMPOP42166 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TMPOP42166 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMPOP42166 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMPOP42166 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMPOP42166 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMPOP42166 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMPOP42166 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
TMPOP42166 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TMPOP42166 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMPOP42166 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMPOP42166 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TMPOP42166 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMPOP42166 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMPOP42166 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TMPOP42166 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMPOP42166 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMPOP42166 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMPOP42166 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMPOP42166 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMPOP42166 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMPOP42166 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMPOP42166 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMPOP42166 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMPOP42166 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMPOP42166 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMPOP42166 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TMPOP42166 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMPOP42166 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMPOP42166 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TMPOP42166 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMPOP42166 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TMPOP42166 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMPOP42166 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMPOP42166 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMPOP42166 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMPOP42166 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMPOP42166 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMPOP42166 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMPOP42166 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMPOP42166 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMPOP42166 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMPOP42166 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMPOP42166 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMPOP42166 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMPOP42166 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMPOP42166 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMPOP42166 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMPOP42166 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMPOP42166 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMPOP42166 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TMPOP42166 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMPOP42166 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms