Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RYKP34925 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RYKP34925 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RYKP34925 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RYKP34925 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RYKP34925 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RYKP34925 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RYKP34925 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RYKP34925 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RYKP34925 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RYKP34925 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RYKP34925 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RYKP34925 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RYKP34925 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RYKP34925 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RYKP34925 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RYKP34925 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RYKP34925 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RYKP34925 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RYKP34925 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RYKP34925 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RYKP34925 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RYKP34925 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RYKP34925 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RYKP34925 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RYKP34925 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RYKP34925 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RYKP34925 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RYKP34925 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RYKP34925 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RYKP34925 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RYKP34925 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RYKP34925 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RYKP34925 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RYKP34925 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RYKP34925 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RYKP34925 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RYKP34925 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RYKP34925 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RYKP34925 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RYKP34925 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RYKP34925 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RYKP34925 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RYKP34925 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RYKP34925 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RYKP34925 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RYKP34925 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RYKP34925 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RYKP34925 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RYKP34925 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RYKP34925 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RYKP34925 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RYKP34925 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RYKP34925 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RYKP34925 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RYKP34925 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RYKP34925 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RYKP34925 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RYKP34925 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RYKP34925 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RYKP34925 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RYKP34925 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RYKP34925 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RYKP34925 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RYKP34925 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RYKP34925 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RYKP34925 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RYKP34925 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RYKP34925 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RYKP34925 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RYKP34925 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RYKP34925 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RYKP34925 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RYKP34925 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RYKP34925 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RYKP34925 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RYKP34925 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RYKP34925 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RYKP34925 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RYKP34925 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RYKP34925 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RYKP34925 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RYKP34925 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RYKP34925 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RYKP34925 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RYKP34925 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RYKP34925 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RYKP34925 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RYKP34925 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RYKP34925 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RYKP34925 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RYKP34925 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RYKP34925 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RYKP34925 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RYKP34925 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RYKP34925 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RYKP34925 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RYKP34925 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RYKP34925 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RYKP34925 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms