Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSP1P33241 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSP1P33241 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSP1P33241 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSP1P33241 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSP1P33241 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSP1P33241 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSP1P33241 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSP1P33241 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSP1P33241 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSP1P33241 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSP1P33241 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSP1P33241 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSP1P33241 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSP1P33241 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSP1P33241 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSP1P33241 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSP1P33241 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LSP1P33241 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LSP1P33241 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LSP1P33241 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LSP1P33241 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSP1P33241 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSP1P33241 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSP1P33241 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSP1P33241 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSP1P33241 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSP1P33241 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSP1P33241 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSP1P33241 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSP1P33241 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSP1P33241 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSP1P33241 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSP1P33241 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSP1P33241 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSP1P33241 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSP1P33241 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSP1P33241 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSP1P33241 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSP1P33241 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSP1P33241 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSP1P33241 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSP1P33241 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSP1P33241 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSP1P33241 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSP1P33241 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSP1P33241 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSP1P33241 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSP1P33241 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSP1P33241 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSP1P33241 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSP1P33241 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSP1P33241 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSP1P33241 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSP1P33241 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LSP1P33241 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSP1P33241 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSP1P33241 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSP1P33241 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSP1P33241 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSP1P33241 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LSP1P33241 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSP1P33241 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSP1P33241 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSP1P33241 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSP1P33241 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSP1P33241 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSP1P33241 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LSP1P33241 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSP1P33241 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSP1P33241 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSP1P33241 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSP1P33241 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSP1P33241 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSP1P33241 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSP1P33241 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSP1P33241 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSP1P33241 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSP1P33241 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSP1P33241 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSP1P33241 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSP1P33241 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSP1P33241 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSP1P33241 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSP1P33241 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSP1P33241 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSP1P33241 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSP1P33241 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSP1P33241 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSP1P33241 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSP1P33241 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSP1P33241 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSP1P33241 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSP1P33241 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSP1P33241 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSP1P33241 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSP1P33241 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSP1P33241 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSP1P33241 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSP1P33241 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms