Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CXCR5P32302 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms