Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT4P19013 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT4P19013 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT4P19013 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT4P19013 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT4P19013 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT4P19013 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT4P19013 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT4P19013 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT4P19013 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT4P19013 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT4P19013 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT4P19013 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT4P19013 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT4P19013 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT4P19013 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT4P19013 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT4P19013 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT4P19013 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT4P19013 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT4P19013 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT4P19013 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT4P19013 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT4P19013 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT4P19013 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT4P19013 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT4P19013 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT4P19013 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT4P19013 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT4P19013 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT4P19013 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT4P19013 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT4P19013 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT4P19013 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT4P19013 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT4P19013 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT4P19013 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT4P19013 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT4P19013 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT4P19013 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT4P19013 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT4P19013 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT4P19013 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT4P19013 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT4P19013 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT4P19013 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT4P19013 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT4P19013 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT4P19013 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT4P19013 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT4P19013 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT4P19013 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT4P19013 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT4P19013 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT4P19013 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT4P19013 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT4P19013 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT4P19013 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT4P19013 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT4P19013 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT4P19013 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT4P19013 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT4P19013 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT4P19013 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT4P19013 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT4P19013 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT4P19013 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT4P19013 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT4P19013 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT4P19013 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT4P19013 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT4P19013 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT4P19013 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT4P19013 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT4P19013 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT4P19013 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT4P19013 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT4P19013 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT4P19013 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT4P19013 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT4P19013 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT4P19013 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT4P19013 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT4P19013 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT4P19013 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT4P19013 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT4P19013 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT4P19013 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT4P19013 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT4P19013 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT4P19013 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT4P19013 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT4P19013 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT4P19013 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT4P19013 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT4P19013 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT4P19013 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT4P19013 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT4P19013 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT4P19013 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms