Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HPGDP15428 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HPGDP15428 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HPGDP15428 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HPGDP15428 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HPGDP15428 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HPGDP15428 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HPGDP15428 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HPGDP15428 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HPGDP15428 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HPGDP15428 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HPGDP15428 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HPGDP15428 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HPGDP15428 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HPGDP15428 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HPGDP15428 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HPGDP15428 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HPGDP15428 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HPGDP15428 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HPGDP15428 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HPGDP15428 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HPGDP15428 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HPGDP15428 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HPGDP15428 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HPGDP15428 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HPGDP15428 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HPGDP15428 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HPGDP15428 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HPGDP15428 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HPGDP15428 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HPGDP15428 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HPGDP15428 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HPGDP15428 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HPGDP15428 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HPGDP15428 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HPGDP15428 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HPGDP15428 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HPGDP15428 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HPGDP15428 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HPGDP15428 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HPGDP15428 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HPGDP15428 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HPGDP15428 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HPGDP15428 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HPGDP15428 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HPGDP15428 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HPGDP15428 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HPGDP15428 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HPGDP15428 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HPGDP15428 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HPGDP15428 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HPGDP15428 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HPGDP15428 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HPGDP15428 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HPGDP15428 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HPGDP15428 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HPGDP15428 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HPGDP15428 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HPGDP15428 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HPGDP15428 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HPGDP15428 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HPGDP15428 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HPGDP15428 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HPGDP15428 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HPGDP15428 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HPGDP15428 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HPGDP15428 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HPGDP15428 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HPGDP15428 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HPGDP15428 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HPGDP15428 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HPGDP15428 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HPGDP15428 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HPGDP15428 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HPGDP15428 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HPGDP15428 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HPGDP15428 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HPGDP15428 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HPGDP15428 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HPGDP15428 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HPGDP15428 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HPGDP15428 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HPGDP15428 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HPGDP15428 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HPGDP15428 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HPGDP15428 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HPGDP15428 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HPGDP15428 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HPGDP15428 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HPGDP15428 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HPGDP15428 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HPGDP15428 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HPGDP15428 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HPGDP15428 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HPGDP15428 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HPGDP15428 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HPGDP15428 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HPGDP15428 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HPGDP15428 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HPGDP15428 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms