Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
VPREB1P12018 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms