Protein–RNA interactions for Protein: P0DP72

VSIG10L2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10L2P0DP72 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VSIG10L2P0DP72 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VSIG10L2P0DP72 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms