Protein–RNA interactions for Protein: P04440

HLA-DPB1, HLA class II histocompatibility antigen, DP beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPB1P04440 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DPB1P04440 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DPB1P04440 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-DPB1P04440 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HLA-DPB1P04440 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HLA-DPB1P04440 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-DPB1P04440 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-DPB1P04440 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-DPB1P04440 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-DPB1P04440 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-DPB1P04440 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-DPB1P04440 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HLA-DPB1P04440 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPB1P04440 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HLA-DPB1P04440 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms