Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGHDP01880 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGHDP01880 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGHDP01880 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHDP01880 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHDP01880 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHDP01880 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHDP01880 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHDP01880 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHDP01880 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHDP01880 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHDP01880 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHDP01880 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHDP01880 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHDP01880 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHDP01880 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHDP01880 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHDP01880 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHDP01880 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHDP01880 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHDP01880 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGHDP01880 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGHDP01880 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGHDP01880 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGHDP01880 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHDP01880 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHDP01880 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHDP01880 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHDP01880 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHDP01880 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHDP01880 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHDP01880 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHDP01880 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHDP01880 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHDP01880 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHDP01880 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHDP01880 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHDP01880 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHDP01880 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHDP01880 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHDP01880 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHDP01880 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHDP01880 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHDP01880 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHDP01880 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHDP01880 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
IGHDP01880 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
IGHDP01880 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IGHDP01880 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IGHDP01880 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IGHDP01880 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
IGHDP01880 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IGHDP01880 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGHDP01880 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGHDP01880 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGHDP01880 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGHDP01880 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
IGHDP01880 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGHDP01880 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGHDP01880 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGHDP01880 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGHDP01880 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGHDP01880 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGHDP01880 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGHDP01880 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGHDP01880 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGHDP01880 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGHDP01880 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGHDP01880 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGHDP01880 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGHDP01880 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGHDP01880 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGHDP01880 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGHDP01880 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGHDP01880 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IGHDP01880 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGHDP01880 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGHDP01880 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGHDP01880 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGHDP01880 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGHDP01880 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGHDP01880 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGHDP01880 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGHDP01880 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGHDP01880 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGHDP01880 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGHDP01880 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGHDP01880 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGHDP01880 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGHDP01880 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGHDP01880 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
IGHDP01880 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGHDP01880 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGHDP01880 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGHDP01880 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGHDP01880 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGHDP01880 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGHDP01880 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGHDP01880 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGHDP01880 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms