Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN13O95857 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN13O95857 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms