Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF2O60811 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF2O60811 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF2O60811 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF2O60811 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEF2O60811 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF2O60811 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF2O60811 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF2O60811 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF2O60811 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF2O60811 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF2O60811 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF2O60811 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEF2O60811 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF2O60811 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF2O60811 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF2O60811 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEF2O60811 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF2O60811 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRAMEF2O60811 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRAMEF2O60811 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF2O60811 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF2O60811 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF2O60811 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms