Protein–RNA interactions for Protein: O60220

TIMM8A, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim8 A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM8AO60220 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TIMM8AO60220 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM8AO60220 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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